สำนักงานขนส่งจังหวัดเพชรบุรี ได้จัดตั้งและเปิดทำการครั้งแรก ประมาณ ปี 2505 โดยในการเปิดทำการครั้งแรกได้เช่าอาคารเป็นบ้านไม้สองชั้น ตั้งอยู่ในซอยทรัพย์สิน ตำบลคลองกระแชง อำเภอเมือง จังหวัดเพชรบุรี ต่อมาในปี 2507 กรมการขนส่งทางบกได้อนุมัติให้สำนักงานขนส่งจังหวัดเพชรบุรีจัดซื้อที่ดิน และปลูกสร้างอาคารสำนักงานขึ้นเป็นอาคารแบบเก่าสองชั้น ในพื้นที่ 4 ไร่ 3 งาน 71 ตารางเมตร ตั้งอยู่ เลขที่ 49 หมู่ 2 ถนนเพชรเกษม ตำบลไร่ส้ม อำเภอเมือง จังหวัดเพชรบุรี และย้ายที่ทำการมาอยู่สำนักงานแห่งใหม่ เมื่อวันที่ 5 มีนาคม 2510 และต่อมา เมื่อปี 2534 ได้ปลูกสร้างอาคารสำนักงานเพิ่มขึ้นอีก 1 หลัง เป็นอาคารสองชั้นในพื้นที่เดียวกัน ซึ่งใช้เป็นสถานที่สำหรับให้บริการประชาชนจนถึงปัจจุบัน