จากการประชุมคณะรัฐมนตรี เมื่อวันที่ 1 พฤษภาคม 2506 ได้มีมติเห็นสมควรดำเนินการพัฒนาภาคตะวันออกให้เจริญยิ่งขึ้น ทั้งทางด้านเศรษฐกิจ การศึกษา การสาธารณสุข การเกษตรและการคมนาคม คณะรัฐมนตรีจึงได้แต่งตั้งคณะกรรมการขึ้นหนึ่งชุดประกอบด้วย พระบำราศนราดูร รัฐมนตรีว่าการกระทรวงสาธารณสุข เป็นประธานคณะกรรมการ คณะกรรมการได้ดำเนินการปรับปรุงพัฒนาจังหวัดภาคตะวันออก โดยลำดับ ในปี พ.ศ.2508 ได้วางโครงการให้กรมการแพทย์ กระทรวงสาธารณสุข จัดตั้งโรงเรียนพยาบาลผดุงครรภ์และอนามัยขึ้นที่โรงพยาบาลพระปกเกล้า โดยใช้ชื่อว่า “โรงเรียนพยาบาลผดุงครรภ์และอนามัย โรงพยาบาลพระปกเกล้า” ทำหน้าที่ผลิตพยาบาลซึ่งกำลังขาดแคลนอยู่ในขณะนั้น

          วิทยาลัยพยาบาลพระปกเกล้า จันทบุรี ได้รับพระมหากรุณาธิคุณจากสมเด็จพระนางเจ้า รำไพพรรณี พระบรมราชินีนาถ ในรัชกาลที่ 7 ทรงรับวิทยาลัย ไว้ในพระบรมราชินูปถัมภ์ ตั้งแต่เปิดทำการ ปี พ.ศ.2508 จนพระองค์เสด็จสวรรคต เมื่อปี พ.ศ.2527 และวิทยาลัยยังได้รับการอุปถัมภ์จากมูลนิธิประชาธิปกรำไพพรรณี อย่างต่อเนื่องจนถึงปัจจุบัน

          วิทยาลัยพยาบาลพระปกเกล้าเปิดดำเนินการครั้งแรกในปีพุทธศักราช 2508 รับบุคคลที่ สำเร็จการศึกษาชั้นมัธยมศึกษาปีที่ 3 เข้าศึกษาในหลักสูตรพยาบาลผดุงครรภ์และอนามัย ระยะเวลาการศึกษา 4 ปีเมื่อสำเร็จการศึกษา ได้รับประกาศนียบัตรพยาบาลผดุงครรภ์และอนามัย

พ.ศ. 2514 กรมการแพทย์ได้มีการเปลี่ยนรับบุคคลที่สำเร็จการศึกษาชั้นมัธยมศึกษาปีที่ 3 เป็นมัธยมศึกษาปีที่ 5 เข้าศึกษาในหลักสูตรพยาบาลและผดุงครรภ์ ระยะเวลาการศึกษา 3 ปีครึ่ง สำเร็จการศึกษาได้รับประกาศนียบัตรพยาบาลและผดุงครรภ์

พ.ศ. 2517 กระทรวงสาธารณสุข ได้มีการปรับปรุงแบ่งส่วนราชการระดับกรมตามประกาศในราชกิจจานุเบกษา เล่มที่ 91 ตอนที่ 153 ลงวันที่ 18 กันยายน 2517 และได้มีการปรับปรุงส่วนราชการระดับกอง ตามประกาศในราชกิจจานุเบกษา เล่มที่ 91 ตอนที่ 210 ลงวันที่ 10 ธันวาคม 2517 โรงเรียนพยาบาลผดุงครรภ์และอนามัย ที่เคยสังกัดอยู่ในฝ่ายวิชาการ กรมการแพทย์และอนามัยเดิม ได้โอนมาอยู่ในสังกัดกองงานวิทยาลัยพยาบาล สำนักงานปลัดกระทรวง กระทรวงสาธารณสุข และเปลี่ยนชื่อจากโรงเรียนพยาบาลผดุงครรภ์และอนามัยโรงพยาบาลพระปกเกล้า เป็นวิทยาลัยพยาบาลพระปกเกล้า จันทบุรี ในปีเดียวกัน กองงานวิทยาลัยพยาบาลได้ปรับปรุงหลักสูตรการพยาบาลผดุงครรภ์และอนามัย จากหลักสูตร 3 ปีครึ่ง เป็นหลักสูตรพยาบาลศาสตร์และผดุงครรภ์ชั้นสูง ระยะเวลาการศึกษา 4 ปี เมื่อสำเร็จการศึกษาได้รับประกาศนียบัตรพยาบาลศาสตร์และผดุงครรภ์ชั้นสูง (เทียบเท่าปริญญาตรี) ต่อมาได้พัฒนาหลักสูตรเป็นหลักสูตรประกาศนียบัตรพยาบาลศาสตร์ที่เน้นชุมชน ในปี พ.ศ. 2528

พ.ศ. 2528 เปิดทำการสอนหลักสูตรประกาศนียบัตรพยาบาลและผดุงครรภ์ (เฉพาะกาล) ระยะเวลาการศึกษา 2 ปี เมื่อสำเร็จการศึกษาได้รับประกาศนียบัตรการพยาบาลและผดุงครรภ์ (พยาบาลเทคนิค) ปิดโครงการในปี พ.ศ.2534

พ.ศ. 2529 เปิดสอนหลักสูตรพยาบาลและผดุงครรภ์ (ต่อเนื่อง) เข้าศึกษาในชั้นปีที่ 3 และปีที่ 4 ระยะเวลาการศึกษา 2 ปี เมื่อสำเร็จการศึกษาได้รับประกาศนียบัตรพยาบาลศาสตร์และผดุงครรภ์ชั้นสูง (เทียบเท่าปริญญาตรี) เปิดสอนเพียง 2 รุ่นและได้เปิดสอนอีกครั้งในปี พ.ศ.2535 โดยใช้ชื่อเป็นหลักสูตรประกาศนียบัตรพยาบาลศาสตร์ (ต่อเนื่อง 2 ปี เทียบเท่าปริญญาตรี)

พ.ศ. 2531 เปิดสอนนักศึกษาหลักสูตรพยาบาลและผดุงครรภ์ระดับต้น (โครงการปกติ) ระยะเวลาการศึกษา 2 ปี ผู้สำเร็จการศึกษาได้รับประกาศนียบัตรพยาบาลและผดุงครรภ์ (พยาบาลเทคนิค) ปิดหลักสูตรในปี พ.ศ.2538 ต่อมาได้พัฒนาหลักสูตรโดยใช้ชื่อ หลักสูตรประกาศนียบัตรพยาบาลศาสตร์ระดับต้น

พ.ศ. 2536 ได้มีการปรับปรุงการแบ่งส่วนราชการสำนักงานปลัดกระทรวง กระทรวงสาธารณสุขโดยการรวมวิทยาลัยพยาบาล วิทยาลัยพยาบาลและผดุงครรภ์ และวิทยาลัยการสาธารณสุขที่สังกัดอยู่ในกรมต่างๆ ของกระทรวงสาธารณสุข มารวมกันเป็นหน่วยงานใหม่ ตั้งเป็นสถาบันพัฒนากำลังคนด้านสาธารณสุข สังกัดสำนักงานปลัดกระทรวง ตามประกาศในราชกิจจานุเบกษา เล่มที่ 110 ตอนที่ 22 ลงวันที่ 26 กุมภาพันธ์ 2536 ฉบับพิเศษ หน้า 21-29

พ.ศ. 2538 มีพระราชกฤษฎีกาเปลี่ยนชื่อสถาบันพัฒนากำลังคนด้านสาธารณสุข เป็นสถาบันพระบรมราชชนก ตามประกาศราชกิจจานุเบกษา เล่ม 112 ตอนที่ 53ก ลงวันที่ 25 ธันวาคม 2538

พ.ศ. 2541 ทบวงมหาวิทยาลัยได้ประกาศรับวิทยาลัยพยาบาลพระปกเกล้า จันทบุรี เข้าเป็นสถาบันสมทบของมหาวิทยาลัยบูรพา ตั้งแต่ปีการศึกษา 2540 เป็นต้นมา หลักสูตรพยาบาลศาสตร์ที่เน้นชุมชน ฉบับปรับปรุงปี 2537 จึงเปลี่ยนชื่อเป็นหลักสูตรพยาบาลศาสตร์และหลักสูตรพยาบาลศาสตร์ (ต่อเนื่อง 2 ปี) ฉบับปี 2535 เปลี่ยนเป็นหลักสูตรพยาบาลศาสตร์ (ต่อเนื่อง)

ปีการศึกษา 2545 เปิดหลักสูตรประกาศนียบัตรพยาบาลศาสตร์เทียบเท่าปริญญาตรี (ต่อเนื่อง 3ปี) ได้เปิดสอนเพียงหนึ่งรุ่นและปิดหลักสูตรลง

ปีการศึกษา 2549 หลักสูตรพยาบาลศาสตรบัณฑิต (ต่อเนื่อง) รุ่นที่ 16 เรียนปีสุดท้ายและปิดหลักสูตรลง

ปีการศึกษา 2550 วิทยาลัยจัดการเรียนการสอน 1 หลักสูตร คือหลักสูตรพยาบาลศาสตรบัณฑิต โดยรุ่นที่ 45 ใช้เอกสารหลักสูตรพยาบาลศาสตรบัณฑิต พ.ศ. 2545 เป็นรุ่นสุดท้าย

ปีการศึกษา 2552 - 2554 รุ่นที่ 46 - 47 ใช้หลักสูตรพยาบาลศาสตรบัณฑิต หลักสูตร ปรับปรุง พ.ศ. 2552

ปีการศึกษา 2555 - 2559 รุ่นที่ 48-52 ใช้หลักสูตรพยาบาลศาสตรบัณฑิต หลักสูตรปรับปรุง พ.ศ. 2555

ปีการศึกษา 2560 รุ่นที่ 53 เป็นต้นไป ใช้หลักสูตรพยาบาลศาสตรบัณฑิต หลักสูตรปรับปรุง พ.ศ. 2560 ตามประกาศกระทรวงศึกษาธิการ เรื่อง มาตรฐานคุณวุฒิระดับปริญญาตรี สาขาพยาบาลศาสตร์ พ.ศ.2558 กำหนดกรอบมาตรฐานคุณวุฒิระดับอุดมศึกษาให้สถาบันอุดมศึกษาใช้เป็นแนวทางในการพัฒนาหรือปรับปรุงหลักสูตรระดับปริญญาตรี สาขาพยาบาลศาสตร์เพื่อประโยชน์ในการรักษาคุณภาพและมาตรฐานการศึกษาระดับปริญญาตรี สาขาพยาบาลศาสตร์ ของสถาบันอุดมศึกษาทุกแห่งให้มีมาตรฐานเทียบเคียงกันได้ทั้งในระดับชาติและระดับสากล โดยสถาบันการศึกษาที่เปิดสอนหลักสูตรนี้อยู่แล้ว ต้องปรับปรุงหลักสูตรให้เป็นไปตามประกาศนี้ภายในปีการศึกษา 2560 วิทยาลัยพยาบาลพระปกเกล้า จันทบุรี จึงได้ปรับปรุงหลักสูตรพยาบาลศาสตรบัณฑิต ให้เป็นไปตามกรอบมาตรฐานคุณวุฒิดังกล่าว ประกอบกับการเปลี่ยนแปลงทางสังคมและวัฒนธรรม โดยเพิ่มอัตลักษณ์ของบัณฑิตที่พึงประสงค์เพื่อตอบสนองความต้องการของชุมชน ได้แก่ พฤติกรรมการบริการสุขภาพด้วยหัวใจความเป็นมนุษย์ มีทักษะในการดูแลสุขภาพผู้ป่วยเรื้อรังและสามารถทำวิจัยหรือร่วมทำวิจัยทางสุขภาพ เบื้องต้นได้

พ.ศ. 2562 พระบาทสมเด็จพระปรเมนทรรามาธิบดีศรีสินทรมหาวชิราลงกรณ มหิศรภูมิพลราชวรางกูรกิติสิริสมบูรณอดุลยเดช สยามินทราธิเบศรราชาวโรดม บรมนาถบพิตร พระวชิรเกล้าเจ้าอยู่หัว มีพระราชโองการโปรดเกล้าฯ ให้ประกาศว่า โดยที่เป็นการสมควรมีกฎหมายว่าด้วยสถาบันพระบรมราชชนก จึงทรงพระกรุณาโปรดเกล้าฯ ให้ตราพระราชบัญญัติสถาบันพระบรมราชชนก พ.ศ. 2562 ขึ้นไว้ และประกาศในราชกิจจานุเบกษา เล่ม 136 ตอนที่ 43 ก วันที่ 5 เมษายน 2562 ให้สถาบันพระบรมราชชนกเป็นสถาบันอุดมศึกษาเฉพาะทางในสังกัดกระทรวงสาธารณสุข เป็นสถาบันอุดมศึกษาในกำกับของกระทรวงสาธารณสุขแห่งแรก มีสถานะเป็นนิติบุคคล มีภารกิจหลักในการผลิตและพัฒนาบุคลากรทางด้านสุขภาพ และเป็นสถานศึกษาเฉพาะทางด้านสุขภาพที่จัดการศึกษาระดับปริญญาด้านพยาบาล การสาธารณสุขและสหเวชศาสตร์